Protein–RNA interactions for Protein: A0A5B9

TRBC2, T-cell receptor beta-2 chain C region, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBC2A0A5B9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TRBC2A0A5B9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRBC2A0A5B9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRBC2A0A5B9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRBC2A0A5B9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRBC2A0A5B9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRBC2A0A5B9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRBC2A0A5B9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRBC2A0A5B9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRBC2A0A5B9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TRBC2A0A5B9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRBC2A0A5B9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRBC2A0A5B9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRBC2A0A5B9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRBC2A0A5B9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRBC2A0A5B9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRBC2A0A5B9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRBC2A0A5B9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRBC2A0A5B9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRBC2A0A5B9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRBC2A0A5B9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRBC2A0A5B9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRBC2A0A5B9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRBC2A0A5B9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRBC2A0A5B9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRBC2A0A5B9 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRBC2A0A5B9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRBC2A0A5B9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRBC2A0A5B9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRBC2A0A5B9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRBC2A0A5B9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRBC2A0A5B9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRBC2A0A5B9 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRBC2A0A5B9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRBC2A0A5B9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRBC2A0A5B9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRBC2A0A5B9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRBC2A0A5B9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRBC2A0A5B9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRBC2A0A5B9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRBC2A0A5B9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRBC2A0A5B9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRBC2A0A5B9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRBC2A0A5B9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRBC2A0A5B9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRBC2A0A5B9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TRBC2A0A5B9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRBC2A0A5B9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRBC2A0A5B9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRBC2A0A5B9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRBC2A0A5B9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRBC2A0A5B9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRBC2A0A5B9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRBC2A0A5B9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRBC2A0A5B9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRBC2A0A5B9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRBC2A0A5B9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRBC2A0A5B9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRBC2A0A5B9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRBC2A0A5B9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TRBC2A0A5B9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRBC2A0A5B9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRBC2A0A5B9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRBC2A0A5B9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRBC2A0A5B9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRBC2A0A5B9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRBC2A0A5B9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRBC2A0A5B9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRBC2A0A5B9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRBC2A0A5B9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TRBC2A0A5B9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRBC2A0A5B9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TRBC2A0A5B9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRBC2A0A5B9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRBC2A0A5B9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRBC2A0A5B9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRBC2A0A5B9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRBC2A0A5B9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRBC2A0A5B9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRBC2A0A5B9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRBC2A0A5B9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRBC2A0A5B9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRBC2A0A5B9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRBC2A0A5B9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRBC2A0A5B9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRBC2A0A5B9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRBC2A0A5B9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRBC2A0A5B9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRBC2A0A5B9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRBC2A0A5B9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TRBC2A0A5B9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TRBC2A0A5B9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRBC2A0A5B9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRBC2A0A5B9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRBC2A0A5B9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRBC2A0A5B9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRBC2A0A5B9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRBC2A0A5B9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRBC2A0A5B9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRBC2A0A5B9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms