Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQS6

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQS6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A0U1RQS6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A0U1RQS6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A0U1RQS6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A0U1RQS6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A0U1RQS6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A0U1RQS6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A0U1RQS6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A0U1RQS6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A0U1RQS6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A0U1RQS6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A0U1RQS6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A0U1RQS6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A0U1RQS6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A0U1RQS6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A0U1RQS6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A0U1RQS6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A0U1RQS6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A0U1RQS6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A0U1RQS6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A0U1RQS6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A0U1RQS6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A0U1RQS6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A0U1RQS6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A0U1RQS6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A0U1RQS6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A0U1RQS6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
A0A0U1RQS6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
A0A0U1RQS6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A0U1RQS6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A0U1RQS6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A0U1RQS6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A0U1RQS6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A0U1RQS6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A0U1RQS6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A0U1RQS6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A0U1RQS6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A0U1RQS6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A0U1RQS6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A0U1RQS6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A0U1RQS6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A0U1RQS6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A0U1RQS6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A0U1RQS6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A0U1RQS6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A0U1RQS6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A0U1RQS6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A0U1RQS6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A0U1RQS6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A0U1RQS6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A0U1RQS6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A0U1RQS6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A0U1RQS6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A0U1RQS6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
A0A0U1RQS6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
A0A0U1RQS6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
A0A0U1RQS6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
A0A0U1RQS6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
A0A0U1RQS6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
A0A0U1RQS6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A0U1RQS6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A0U1RQS6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A0U1RQS6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A0U1RQS6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A0U1RQS6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A0U1RQS6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A0U1RQS6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A0U1RQS6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A0U1RQS6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A0U1RQS6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A0U1RQS6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A0U1RQS6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A0U1RQS6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A0U1RQS6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A0U1RQS6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A0U1RQS6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A0U1RQS6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A0U1RQS6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A0U1RQS6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A0U1RQS6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A0U1RQS6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A0U1RQS6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A0U1RQS6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A0U1RQS6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A0U1RQS6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A0U1RQS6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A0U1RQS6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
A0A0U1RQS6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
A0A0U1RQS6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
A0A0U1RQS6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
A0A0U1RQS6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
A0A0U1RQS6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
A0A0U1RQS6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
A0A0U1RQS6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23■■□□□ 1.27
A0A0U1RQS6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
A0A0U1RQS6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23■■□□□ 1.27
A0A0U1RQS6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
A0A0U1RQS6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
A0A0U1RQS6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
A0A0U1RQS6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms