Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH7

SNX6, Sorting nexin-6, humanhuman

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX6Q9UNH7 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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SNX6Q9UNH7 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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SNX6Q9UNH7 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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SNX6Q9UNH7 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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SNX6Q9UNH7 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SNX6Q9UNH7 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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