Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms