Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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RAB23Q9ULC3 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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RAB23Q9ULC3 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB23Q9ULC3 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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