Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL40

ZNF346, Zinc finger protein 346, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF346Q9UL40 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF346Q9UL40 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF346Q9UL40 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF346Q9UL40 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF346Q9UL40 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF346Q9UL40 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF346Q9UL40 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF346Q9UL40 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF346Q9UL40 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF346Q9UL40 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF346Q9UL40 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF346Q9UL40 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF346Q9UL40 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF346Q9UL40 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF346Q9UL40 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF346Q9UL40 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF346Q9UL40 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF346Q9UL40 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF346Q9UL40 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF346Q9UL40 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF346Q9UL40 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF346Q9UL40 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF346Q9UL40 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF346Q9UL40 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF346Q9UL40 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF346Q9UL40 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF346Q9UL40 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF346Q9UL40 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF346Q9UL40 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF346Q9UL40 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF346Q9UL40 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF346Q9UL40 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF346Q9UL40 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF346Q9UL40 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF346Q9UL40 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF346Q9UL40 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF346Q9UL40 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF346Q9UL40 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF346Q9UL40 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF346Q9UL40 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF346Q9UL40 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF346Q9UL40 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF346Q9UL40 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF346Q9UL40 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF346Q9UL40 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ZNF346Q9UL40 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF346Q9UL40 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF346Q9UL40 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF346Q9UL40 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF346Q9UL40 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF346Q9UL40 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF346Q9UL40 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF346Q9UL40 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF346Q9UL40 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF346Q9UL40 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF346Q9UL40 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF346Q9UL40 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF346Q9UL40 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF346Q9UL40 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF346Q9UL40 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF346Q9UL40 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF346Q9UL40 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF346Q9UL40 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF346Q9UL40 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF346Q9UL40 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF346Q9UL40 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF346Q9UL40 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF346Q9UL40 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF346Q9UL40 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF346Q9UL40 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF346Q9UL40 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF346Q9UL40 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF346Q9UL40 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF346Q9UL40 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF346Q9UL40 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF346Q9UL40 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF346Q9UL40 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF346Q9UL40 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF346Q9UL40 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF346Q9UL40 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF346Q9UL40 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF346Q9UL40 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF346Q9UL40 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF346Q9UL40 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF346Q9UL40 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF346Q9UL40 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF346Q9UL40 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF346Q9UL40 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF346Q9UL40 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF346Q9UL40 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF346Q9UL40 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF346Q9UL40 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF346Q9UL40 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF346Q9UL40 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF346Q9UL40 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF346Q9UL40 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF346Q9UL40 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC13.65□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF346Q9UL40 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms