Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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