Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2V4

LRIT1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 623 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIT1Q9P2V4 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LRIT1Q9P2V4 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LRIT1Q9P2V4 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LRIT1Q9P2V4 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LRIT1Q9P2V4 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LRIT1Q9P2V4 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LRIT1Q9P2V4 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LRIT1Q9P2V4 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LRIT1Q9P2V4 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LRIT1Q9P2V4 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LRIT1Q9P2V4 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LRIT1Q9P2V4 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LRIT1Q9P2V4 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LRIT1Q9P2V4 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LRIT1Q9P2V4 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LRIT1Q9P2V4 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LRIT1Q9P2V4 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LRIT1Q9P2V4 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
LRIT1Q9P2V4 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LRIT1Q9P2V4 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LRIT1Q9P2V4 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LRIT1Q9P2V4 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
LRIT1Q9P2V4 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LRIT1Q9P2V4 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
LRIT1Q9P2V4 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LRIT1Q9P2V4 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LRIT1Q9P2V4 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LRIT1Q9P2V4 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LRIT1Q9P2V4 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LRIT1Q9P2V4 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LRIT1Q9P2V4 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LRIT1Q9P2V4 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LRIT1Q9P2V4 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LRIT1Q9P2V4 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LRIT1Q9P2V4 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LRIT1Q9P2V4 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LRIT1Q9P2V4 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LRIT1Q9P2V4 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LRIT1Q9P2V4 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LRIT1Q9P2V4 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LRIT1Q9P2V4 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LRIT1Q9P2V4 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LRIT1Q9P2V4 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LRIT1Q9P2V4 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LRIT1Q9P2V4 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LRIT1Q9P2V4 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LRIT1Q9P2V4 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LRIT1Q9P2V4 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LRIT1Q9P2V4 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LRIT1Q9P2V4 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LRIT1Q9P2V4 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LRIT1Q9P2V4 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LRIT1Q9P2V4 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LRIT1Q9P2V4 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LRIT1Q9P2V4 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LRIT1Q9P2V4 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LRIT1Q9P2V4 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LRIT1Q9P2V4 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRIT1Q9P2V4 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRIT1Q9P2V4 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRIT1Q9P2V4 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRIT1Q9P2V4 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRIT1Q9P2V4 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRIT1Q9P2V4 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRIT1Q9P2V4 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRIT1Q9P2V4 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRIT1Q9P2V4 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
LRIT1Q9P2V4 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRIT1Q9P2V4 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRIT1Q9P2V4 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRIT1Q9P2V4 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRIT1Q9P2V4 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRIT1Q9P2V4 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRIT1Q9P2V4 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRIT1Q9P2V4 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRIT1Q9P2V4 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRIT1Q9P2V4 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRIT1Q9P2V4 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRIT1Q9P2V4 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRIT1Q9P2V4 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRIT1Q9P2V4 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRIT1Q9P2V4 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRIT1Q9P2V4 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRIT1Q9P2V4 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRIT1Q9P2V4 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRIT1Q9P2V4 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRIT1Q9P2V4 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRIT1Q9P2V4 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRIT1Q9P2V4 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRIT1Q9P2V4 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRIT1Q9P2V4 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
LRIT1Q9P2V4 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
LRIT1Q9P2V4 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
LRIT1Q9P2V4 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
LRIT1Q9P2V4 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRIT1Q9P2V4 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
LRIT1Q9P2V4 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRIT1Q9P2V4 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRIT1Q9P2V4 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LRIT1Q9P2V4 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
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