Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms