Protein–RNA interactions for Protein: Q9P035

HACD3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD3Q9P035 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms