Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP91

SLC6A20, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3, humanhuman

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A20Q9NP91 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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