Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K1

SLC39A8, Zinc transporter ZIP8, humanhuman

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Length 460 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A8Q9C0K1 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC39A8Q9C0K1 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC39A8Q9C0K1 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC39A8Q9C0K1 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC39A8Q9C0K1 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC39A8Q9C0K1 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC39A8Q9C0K1 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC39A8Q9C0K1 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC39A8Q9C0K1 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC39A8Q9C0K1 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC39A8Q9C0K1 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC39A8Q9C0K1 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC39A8Q9C0K1 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC39A8Q9C0K1 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC39A8Q9C0K1 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC39A8Q9C0K1 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC39A8Q9C0K1 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC39A8Q9C0K1 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC39A8Q9C0K1 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC39A8Q9C0K1 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC39A8Q9C0K1 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC39A8Q9C0K1 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC39A8Q9C0K1 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC39A8Q9C0K1 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC39A8Q9C0K1 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC39A8Q9C0K1 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC39A8Q9C0K1 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC39A8Q9C0K1 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC39A8Q9C0K1 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC39A8Q9C0K1 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC39A8Q9C0K1 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC39A8Q9C0K1 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC39A8Q9C0K1 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC39A8Q9C0K1 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC39A8Q9C0K1 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC39A8Q9C0K1 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC39A8Q9C0K1 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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SLC39A8Q9C0K1 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC39A8Q9C0K1 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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