Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0E8

LNPK, Protein lunapark, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNPKQ9C0E8 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LNPKQ9C0E8 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
LNPKQ9C0E8 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
LNPKQ9C0E8 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LNPKQ9C0E8 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LNPKQ9C0E8 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LNPKQ9C0E8 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LNPKQ9C0E8 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LNPKQ9C0E8 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LNPKQ9C0E8 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LNPKQ9C0E8 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LNPKQ9C0E8 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LNPKQ9C0E8 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LNPKQ9C0E8 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LNPKQ9C0E8 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LNPKQ9C0E8 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LNPKQ9C0E8 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LNPKQ9C0E8 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LNPKQ9C0E8 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LNPKQ9C0E8 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LNPKQ9C0E8 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LNPKQ9C0E8 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LNPKQ9C0E8 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LNPKQ9C0E8 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LNPKQ9C0E8 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LNPKQ9C0E8 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LNPKQ9C0E8 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LNPKQ9C0E8 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LNPKQ9C0E8 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
LNPKQ9C0E8 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LNPKQ9C0E8 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LNPKQ9C0E8 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LNPKQ9C0E8 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LNPKQ9C0E8 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LNPKQ9C0E8 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LNPKQ9C0E8 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LNPKQ9C0E8 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
LNPKQ9C0E8 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LNPKQ9C0E8 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LNPKQ9C0E8 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LNPKQ9C0E8 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LNPKQ9C0E8 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LNPKQ9C0E8 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LNPKQ9C0E8 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LNPKQ9C0E8 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LNPKQ9C0E8 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LNPKQ9C0E8 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LNPKQ9C0E8 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LNPKQ9C0E8 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LNPKQ9C0E8 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LNPKQ9C0E8 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LNPKQ9C0E8 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LNPKQ9C0E8 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LNPKQ9C0E8 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
LNPKQ9C0E8 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LNPKQ9C0E8 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LNPKQ9C0E8 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LNPKQ9C0E8 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LNPKQ9C0E8 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LNPKQ9C0E8 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LNPKQ9C0E8 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LNPKQ9C0E8 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LNPKQ9C0E8 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LNPKQ9C0E8 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LNPKQ9C0E8 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LNPKQ9C0E8 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LNPKQ9C0E8 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LNPKQ9C0E8 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LNPKQ9C0E8 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LNPKQ9C0E8 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LNPKQ9C0E8 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
LNPKQ9C0E8 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LNPKQ9C0E8 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LNPKQ9C0E8 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LNPKQ9C0E8 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LNPKQ9C0E8 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LNPKQ9C0E8 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LNPKQ9C0E8 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LNPKQ9C0E8 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LNPKQ9C0E8 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
LNPKQ9C0E8 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LNPKQ9C0E8 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LNPKQ9C0E8 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LNPKQ9C0E8 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LNPKQ9C0E8 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LNPKQ9C0E8 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LNPKQ9C0E8 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LNPKQ9C0E8 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LNPKQ9C0E8 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LNPKQ9C0E8 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LNPKQ9C0E8 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LNPKQ9C0E8 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LNPKQ9C0E8 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LNPKQ9C0E8 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LNPKQ9C0E8 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LNPKQ9C0E8 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LNPKQ9C0E8 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LNPKQ9C0E8 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LNPKQ9C0E8 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LNPKQ9C0E8 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms