Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXU9

CALN1, Calcium-binding protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALN1Q9BXU9 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CALN1Q9BXU9 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CALN1Q9BXU9 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CALN1Q9BXU9 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CALN1Q9BXU9 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CALN1Q9BXU9 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CALN1Q9BXU9 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CALN1Q9BXU9 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CALN1Q9BXU9 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CALN1Q9BXU9 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALN1Q9BXU9 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CALN1Q9BXU9 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALN1Q9BXU9 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALN1Q9BXU9 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALN1Q9BXU9 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALN1Q9BXU9 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALN1Q9BXU9 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALN1Q9BXU9 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALN1Q9BXU9 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALN1Q9BXU9 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALN1Q9BXU9 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALN1Q9BXU9 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALN1Q9BXU9 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALN1Q9BXU9 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALN1Q9BXU9 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CALN1Q9BXU9 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALN1Q9BXU9 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALN1Q9BXU9 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALN1Q9BXU9 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALN1Q9BXU9 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALN1Q9BXU9 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALN1Q9BXU9 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALN1Q9BXU9 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALN1Q9BXU9 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALN1Q9BXU9 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALN1Q9BXU9 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALN1Q9BXU9 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALN1Q9BXU9 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALN1Q9BXU9 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALN1Q9BXU9 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CALN1Q9BXU9 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALN1Q9BXU9 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALN1Q9BXU9 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALN1Q9BXU9 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALN1Q9BXU9 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALN1Q9BXU9 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALN1Q9BXU9 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALN1Q9BXU9 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALN1Q9BXU9 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALN1Q9BXU9 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALN1Q9BXU9 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALN1Q9BXU9 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALN1Q9BXU9 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALN1Q9BXU9 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALN1Q9BXU9 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALN1Q9BXU9 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALN1Q9BXU9 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALN1Q9BXU9 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALN1Q9BXU9 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALN1Q9BXU9 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALN1Q9BXU9 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALN1Q9BXU9 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALN1Q9BXU9 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALN1Q9BXU9 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALN1Q9BXU9 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALN1Q9BXU9 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALN1Q9BXU9 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALN1Q9BXU9 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALN1Q9BXU9 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CALN1Q9BXU9 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALN1Q9BXU9 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALN1Q9BXU9 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALN1Q9BXU9 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALN1Q9BXU9 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALN1Q9BXU9 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALN1Q9BXU9 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALN1Q9BXU9 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALN1Q9BXU9 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALN1Q9BXU9 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALN1Q9BXU9 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALN1Q9BXU9 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALN1Q9BXU9 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALN1Q9BXU9 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALN1Q9BXU9 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALN1Q9BXU9 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALN1Q9BXU9 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CALN1Q9BXU9 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALN1Q9BXU9 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALN1Q9BXU9 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALN1Q9BXU9 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALN1Q9BXU9 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALN1Q9BXU9 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CALN1Q9BXU9 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CALN1Q9BXU9 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALN1Q9BXU9 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALN1Q9BXU9 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALN1Q9BXU9 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALN1Q9BXU9 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALN1Q9BXU9 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALN1Q9BXU9 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms