Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 C3orf38-204ENST00000486971 1259 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF17Q9BXT8 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 AL606763.1-201ENST00000629535 462 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.3 ms