Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FYCO1Q9BQS8 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms