Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC9.1□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC9.1□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC9.1□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 TRAF3-201ENST00000347662 7700 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 BCL2L11-221ENST00000621302 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 BCL2L11-222ENST00000622509 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 SLC46A1-208ENST00000618626 5363 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 USO1-201ENST00000264904 4135 ntTSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 USP19-206ENST00000417901 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 PTPRK-204ENST00000368210 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 SMC4-202ENST00000357388 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 TNS1-205ENST00000419504 5921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 VPS13A-204ENST00000376634 10269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 AC141928.1-201ENST00000511928 4525 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 POLE-201ENST00000320574 7840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC9.09□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 AL357143.1-202ENST00000640531 5777 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 PDXK-201ENST00000291565 7366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 FAM131B-203ENST00000409408 5856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 TRAK1-201ENST00000327628 5293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC9.09□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC9.09□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.09□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.09□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC9.09□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC9.09□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
RETNLBQ9BQ08 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms