Protein–RNA interactions for Protein: Q99717

SMAD5, Mothers against decapentaplegic homolog 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5Q99717 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 KC6-207ENST00000600644 2311 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMAD5Q99717 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms