Protein–RNA interactions for Protein: Q99453

PHOX2B, Paired mesoderm homeobox protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2BQ99453 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 FAM27E5-201ENST00000426869 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 LINC01056-201ENST00000455711 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms