Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SIN3AQ96ST3 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
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