Protein–RNA interactions for Protein: Q96S65

CSRNP1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP1Q96S65 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CSRNP1Q96S65 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CSRNP1Q96S65 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CSRNP1Q96S65 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CSRNP1Q96S65 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CSRNP1Q96S65 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CSRNP1Q96S65 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CSRNP1Q96S65 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CSRNP1Q96S65 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CSRNP1Q96S65 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CSRNP1Q96S65 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSRNP1Q96S65 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSRNP1Q96S65 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSRNP1Q96S65 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSRNP1Q96S65 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSRNP1Q96S65 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSRNP1Q96S65 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSRNP1Q96S65 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSRNP1Q96S65 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CSRNP1Q96S65 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSRNP1Q96S65 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSRNP1Q96S65 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSRNP1Q96S65 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSRNP1Q96S65 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSRNP1Q96S65 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSRNP1Q96S65 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSRNP1Q96S65 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSRNP1Q96S65 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSRNP1Q96S65 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CSRNP1Q96S65 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSRNP1Q96S65 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSRNP1Q96S65 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSRNP1Q96S65 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSRNP1Q96S65 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSRNP1Q96S65 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSRNP1Q96S65 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSRNP1Q96S65 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CSRNP1Q96S65 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSRNP1Q96S65 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSRNP1Q96S65 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSRNP1Q96S65 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSRNP1Q96S65 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSRNP1Q96S65 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSRNP1Q96S65 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSRNP1Q96S65 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSRNP1Q96S65 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSRNP1Q96S65 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSRNP1Q96S65 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSRNP1Q96S65 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSRNP1Q96S65 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSRNP1Q96S65 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSRNP1Q96S65 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSRNP1Q96S65 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSRNP1Q96S65 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSRNP1Q96S65 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.4 ms