Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF7

GCNA, Acidic repeat-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNAQ96QF7 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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GCNAQ96QF7 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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