Protein–RNA interactions for Protein: Q96FE5

LINGO1, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINGO1Q96FE5 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
LINGO1Q96FE5 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms