Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC9

OTUB2, Ubiquitin thioesterase OTUB2, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUB2Q96DC9 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OTUB2Q96DC9 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms