Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RNF34Q969K3 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms