Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP13Q92995 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP13Q92995 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP13Q92995 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP13Q92995 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP13Q92995 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP13Q92995 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP13Q92995 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP13Q92995 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP13Q92995 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP13Q92995 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP13Q92995 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP13Q92995 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP13Q92995 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP13Q92995 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP13Q92995 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP13Q92995 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP13Q92995 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP13Q92995 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP13Q92995 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP13Q92995 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP13Q92995 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP13Q92995 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP13Q92995 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP13Q92995 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP13Q92995 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP13Q92995 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP13Q92995 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP13Q92995 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP13Q92995 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
USP13Q92995 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP13Q92995 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP13Q92995 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP13Q92995 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
USP13Q92995 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP13Q92995 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP13Q92995 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP13Q92995 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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USP13Q92995 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
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USP13Q92995 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP13Q92995 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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USP13Q92995 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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USP13Q92995 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP13Q92995 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP13Q92995 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP13Q92995 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
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USP13Q92995 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP13Q92995 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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USP13Q92995 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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USP13Q92995 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP13Q92995 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP13Q92995 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP13Q92995 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP13Q92995 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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USP13Q92995 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP13Q92995 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP13Q92995 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP13Q92995 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP13Q92995 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP13Q92995 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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USP13Q92995 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP13Q92995 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
USP13Q92995 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
USP13Q92995 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
USP13Q92995 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP13Q92995 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP13Q92995 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP13Q92995 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP13Q92995 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
USP13Q92995 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP13Q92995 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP13Q92995 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP13Q92995 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP13Q92995 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP13Q92995 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP13Q92995 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP13Q92995 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP13Q92995 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP13Q92995 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP13Q92995 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
USP13Q92995 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP13Q92995 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP13Q92995 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
USP13Q92995 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP13Q92995 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP13Q92995 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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