Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms