Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDB6

DTX3L, E3 ubiquitin-protein ligase DTX3L, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3LQ8TDB6 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DTX3LQ8TDB6 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms