Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LMO3Q8TAP4 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMO3Q8TAP4 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMO3Q8TAP4 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LMO3Q8TAP4 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMO3Q8TAP4 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMO3Q8TAP4 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMO3Q8TAP4 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMO3Q8TAP4 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LMO3Q8TAP4 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMO3Q8TAP4 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LMO3Q8TAP4 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMO3Q8TAP4 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMO3Q8TAP4 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMO3Q8TAP4 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMO3Q8TAP4 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMO3Q8TAP4 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMO3Q8TAP4 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMO3Q8TAP4 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMO3Q8TAP4 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMO3Q8TAP4 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LMO3Q8TAP4 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMO3Q8TAP4 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMO3Q8TAP4 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMO3Q8TAP4 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMO3Q8TAP4 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMO3Q8TAP4 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMO3Q8TAP4 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMO3Q8TAP4 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMO3Q8TAP4 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMO3Q8TAP4 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMO3Q8TAP4 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMO3Q8TAP4 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMO3Q8TAP4 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMO3Q8TAP4 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMO3Q8TAP4 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMO3Q8TAP4 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMO3Q8TAP4 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMO3Q8TAP4 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMO3Q8TAP4 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMO3Q8TAP4 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMO3Q8TAP4 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMO3Q8TAP4 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMO3Q8TAP4 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LMO3Q8TAP4 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMO3Q8TAP4 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMO3Q8TAP4 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMO3Q8TAP4 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMO3Q8TAP4 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMO3Q8TAP4 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMO3Q8TAP4 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMO3Q8TAP4 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMO3Q8TAP4 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMO3Q8TAP4 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMO3Q8TAP4 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMO3Q8TAP4 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMO3Q8TAP4 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMO3Q8TAP4 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMO3Q8TAP4 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMO3Q8TAP4 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMO3Q8TAP4 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LMO3Q8TAP4 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LMO3Q8TAP4 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LMO3Q8TAP4 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LMO3Q8TAP4 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LMO3Q8TAP4 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LMO3Q8TAP4 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LMO3Q8TAP4 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LMO3Q8TAP4 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LMO3Q8TAP4 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMO3Q8TAP4 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 168.4 ms