Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6L0

CCDC155, Protein KASH5, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC155Q8N6L0 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms