Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 STRA6-206ENST00000449139 2732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 KRTAP10-4-201ENST00000400374 1643 ntAPPRIS P2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 PARP3-202ENST00000417220 2472 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 DLX1-201ENST00000341900 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 DUSP10-201ENST00000366899 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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