Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX27

VSTM1, V-set and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM1Q6UX27 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.3 ms