Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIJ6

FBXO38, F-box only protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO38Q6PIJ6 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FBXO38Q6PIJ6 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FBXO38Q6PIJ6 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FBXO38Q6PIJ6 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FBXO38Q6PIJ6 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FBXO38Q6PIJ6 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FBXO38Q6PIJ6 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FBXO38Q6PIJ6 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FBXO38Q6PIJ6 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FBXO38Q6PIJ6 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FBXO38Q6PIJ6 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FBXO38Q6PIJ6 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FBXO38Q6PIJ6 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FBXO38Q6PIJ6 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FBXO38Q6PIJ6 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FBXO38Q6PIJ6 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FBXO38Q6PIJ6 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FBXO38Q6PIJ6 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FBXO38Q6PIJ6 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FBXO38Q6PIJ6 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FBXO38Q6PIJ6 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FBXO38Q6PIJ6 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FBXO38Q6PIJ6 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FBXO38Q6PIJ6 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FBXO38Q6PIJ6 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FBXO38Q6PIJ6 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FBXO38Q6PIJ6 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FBXO38Q6PIJ6 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FBXO38Q6PIJ6 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FBXO38Q6PIJ6 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FBXO38Q6PIJ6 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FBXO38Q6PIJ6 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FBXO38Q6PIJ6 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FBXO38Q6PIJ6 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FBXO38Q6PIJ6 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FBXO38Q6PIJ6 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FBXO38Q6PIJ6 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FBXO38Q6PIJ6 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FBXO38Q6PIJ6 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FBXO38Q6PIJ6 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FBXO38Q6PIJ6 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FBXO38Q6PIJ6 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FBXO38Q6PIJ6 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FBXO38Q6PIJ6 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FBXO38Q6PIJ6 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FBXO38Q6PIJ6 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FBXO38Q6PIJ6 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FBXO38Q6PIJ6 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FBXO38Q6PIJ6 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FBXO38Q6PIJ6 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FBXO38Q6PIJ6 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FBXO38Q6PIJ6 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FBXO38Q6PIJ6 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FBXO38Q6PIJ6 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FBXO38Q6PIJ6 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FBXO38Q6PIJ6 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FBXO38Q6PIJ6 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FBXO38Q6PIJ6 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FBXO38Q6PIJ6 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FBXO38Q6PIJ6 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FBXO38Q6PIJ6 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FBXO38Q6PIJ6 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FBXO38Q6PIJ6 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FBXO38Q6PIJ6 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FBXO38Q6PIJ6 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FBXO38Q6PIJ6 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FBXO38Q6PIJ6 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FBXO38Q6PIJ6 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FBXO38Q6PIJ6 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FBXO38Q6PIJ6 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FBXO38Q6PIJ6 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FBXO38Q6PIJ6 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FBXO38Q6PIJ6 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FBXO38Q6PIJ6 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
FBXO38Q6PIJ6 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FBXO38Q6PIJ6 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FBXO38Q6PIJ6 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FBXO38Q6PIJ6 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FBXO38Q6PIJ6 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
FBXO38Q6PIJ6 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
FBXO38Q6PIJ6 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FBXO38Q6PIJ6 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FBXO38Q6PIJ6 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FBXO38Q6PIJ6 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FBXO38Q6PIJ6 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FBXO38Q6PIJ6 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FBXO38Q6PIJ6 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FBXO38Q6PIJ6 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FBXO38Q6PIJ6 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FBXO38Q6PIJ6 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FBXO38Q6PIJ6 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FBXO38Q6PIJ6 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FBXO38Q6PIJ6 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FBXO38Q6PIJ6 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FBXO38Q6PIJ6 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FBXO38Q6PIJ6 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FBXO38Q6PIJ6 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FBXO38Q6PIJ6 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FBXO38Q6PIJ6 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FBXO38Q6PIJ6 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms