Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWP2

FAM46C, Putative nucleotidyltransferase FAM46C, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46CQ5VWP2 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.9 ms