Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TTLL9Q3SXZ7 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.3 ms