Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 SMIM27-203ENST00000451672 2382 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 DNAJB12-204ENST00000461919 2369 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 TMCO4-202ENST00000375127 2403 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 KDM2B-215ENST00000542973 3170 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 GRHL3-203ENST00000356046 2804 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 ECD-205ENST00000454759 2084 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 TMPRSS4-213ENST00000522824 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 STK24-201ENST00000376547 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 ZMYM5-201ENST00000337963 3268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 SLC25A35-203ENST00000579192 2136 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 PLOD3-201ENST00000223127 2920 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 LINC00343-203ENST00000454555 1765 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms