Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EDRF1Q3B7T1 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EDRF1Q3B7T1 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms