Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88 ms