Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
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CCDC96Q2M329 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
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CCDC96Q2M329 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
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CCDC96Q2M329 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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CCDC96Q2M329 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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CCDC96Q2M329 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
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CCDC96Q2M329 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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CCDC96Q2M329 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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CCDC96Q2M329 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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CCDC96Q2M329 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC96Q2M329 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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