Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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