Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PTPROQ16827 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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PTPROQ16827 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
PTPROQ16827 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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PTPROQ16827 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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PTPROQ16827 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPROQ16827 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPROQ16827 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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PTPROQ16827 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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PTPROQ16827 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPROQ16827 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPROQ16827 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPROQ16827 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPROQ16827 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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PTPROQ16827 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPROQ16827 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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PTPROQ16827 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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PTPROQ16827 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPROQ16827 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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PTPROQ16827 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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PTPROQ16827 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPROQ16827 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPROQ16827 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
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PTPROQ16827 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
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PTPROQ16827 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPROQ16827 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPROQ16827 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPROQ16827 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPROQ16827 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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