Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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SSX1Q16384 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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