Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
UBE3CQ15386 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.9 ms