Protein–RNA interactions for Protein: Q14596

NBR1, Next to BRCA1 gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBR1Q14596 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NBR1Q14596 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
NBR1Q14596 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NBR1Q14596 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NBR1Q14596 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NBR1Q14596 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NBR1Q14596 TOLLIP-203ENST00000525159 3429 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NBR1Q14596 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NBR1Q14596 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NBR1Q14596 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NBR1Q14596 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NBR1Q14596 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NBR1Q14596 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NBR1Q14596 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NBR1Q14596 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NBR1Q14596 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NBR1Q14596 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NBR1Q14596 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NBR1Q14596 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NBR1Q14596 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NBR1Q14596 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NBR1Q14596 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NBR1Q14596 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NBR1Q14596 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NBR1Q14596 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NBR1Q14596 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NBR1Q14596 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NBR1Q14596 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NBR1Q14596 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NBR1Q14596 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NBR1Q14596 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NBR1Q14596 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NBR1Q14596 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NBR1Q14596 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NBR1Q14596 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NBR1Q14596 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NBR1Q14596 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
NBR1Q14596 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NBR1Q14596 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NBR1Q14596 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NBR1Q14596 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NBR1Q14596 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NBR1Q14596 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NBR1Q14596 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NBR1Q14596 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NBR1Q14596 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
NBR1Q14596 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NBR1Q14596 AL121827.1-201ENST00000370257 3264 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NBR1Q14596 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NBR1Q14596 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NBR1Q14596 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NBR1Q14596 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NBR1Q14596 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NBR1Q14596 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NBR1Q14596 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NBR1Q14596 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NBR1Q14596 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NBR1Q14596 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
NBR1Q14596 IRF2BPL-201ENST00000238647 4157 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
NBR1Q14596 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
NBR1Q14596 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
NBR1Q14596 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NBR1Q14596 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
NBR1Q14596 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
NBR1Q14596 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NBR1Q14596 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
NBR1Q14596 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NBR1Q14596 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NBR1Q14596 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NBR1Q14596 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NBR1Q14596 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NBR1Q14596 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
NBR1Q14596 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NBR1Q14596 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NBR1Q14596 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
NBR1Q14596 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
NBR1Q14596 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
NBR1Q14596 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NBR1Q14596 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
NBR1Q14596 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NBR1Q14596 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NBR1Q14596 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NBR1Q14596 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NBR1Q14596 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NBR1Q14596 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NBR1Q14596 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NBR1Q14596 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NBR1Q14596 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
NBR1Q14596 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NBR1Q14596 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NBR1Q14596 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NBR1Q14596 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NBR1Q14596 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NBR1Q14596 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NBR1Q14596 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NBR1Q14596 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NBR1Q14596 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NBR1Q14596 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NBR1Q14596 CYTH1-215ENST00000591455 3286 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NBR1Q14596 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms