Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
APOFQ13790 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
APOFQ13790 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
APOFQ13790 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
APOFQ13790 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
APOFQ13790 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
APOFQ13790 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
APOFQ13790 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
APOFQ13790 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
APOFQ13790 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
APOFQ13790 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
APOFQ13790 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
APOFQ13790 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
APOFQ13790 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
APOFQ13790 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
APOFQ13790 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
APOFQ13790 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
APOFQ13790 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
APOFQ13790 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
APOFQ13790 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
APOFQ13790 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
APOFQ13790 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
APOFQ13790 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
APOFQ13790 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
APOFQ13790 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
APOFQ13790 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
APOFQ13790 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.15
APOFQ13790 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
APOFQ13790 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
APOFQ13790 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
APOFQ13790 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
APOFQ13790 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
APOFQ13790 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
APOFQ13790 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
APOFQ13790 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
APOFQ13790 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
APOFQ13790 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
APOFQ13790 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
APOFQ13790 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
APOFQ13790 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
APOFQ13790 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
APOFQ13790 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
APOFQ13790 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
APOFQ13790 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
APOFQ13790 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
APOFQ13790 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
APOFQ13790 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
APOFQ13790 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
APOFQ13790 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.08□□□□□ -0.16
APOFQ13790 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC14.08□□□□□ -0.16
APOFQ13790 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
APOFQ13790 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
APOFQ13790 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
APOFQ13790 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
APOFQ13790 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
APOFQ13790 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
APOFQ13790 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC14.08□□□□□ -0.16
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APOFQ13790 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
APOFQ13790 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
APOFQ13790 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
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APOFQ13790 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
APOFQ13790 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
APOFQ13790 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
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APOFQ13790 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
APOFQ13790 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
APOFQ13790 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
APOFQ13790 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
APOFQ13790 C12orf43-202ENST00000445832 2397 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
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APOFQ13790 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
APOFQ13790 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
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APOFQ13790 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
APOFQ13790 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
APOFQ13790 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
APOFQ13790 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
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APOFQ13790 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
APOFQ13790 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
APOFQ13790 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
APOFQ13790 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
APOFQ13790 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
APOFQ13790 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
APOFQ13790 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
APOFQ13790 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC14.07□□□□□ -0.16
APOFQ13790 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC14.07□□□□□ -0.16
APOFQ13790 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
APOFQ13790 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
APOFQ13790 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
APOFQ13790 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
APOFQ13790 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
APOFQ13790 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
APOFQ13790 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
APOFQ13790 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
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