Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HTR4Q13639 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
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