Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 C3orf38-204ENST00000486971 1259 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SMAD4Q13485 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMAD4Q13485 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
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