Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BNIP3Q12983 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms