Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

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Length 350 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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TWF1Q12792 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TWF1Q12792 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TWF1Q12792 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TWF1Q12792 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TWF1Q12792 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TWF1Q12792 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TWF1Q12792 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TWF1Q12792 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TWF1Q12792 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TWF1Q12792 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TWF1Q12792 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TWF1Q12792 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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TWF1Q12792 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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TWF1Q12792 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TWF1Q12792 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TWF1Q12792 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TWF1Q12792 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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TWF1Q12792 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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TWF1Q12792 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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TWF1Q12792 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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TWF1Q12792 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TWF1Q12792 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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