Protein–RNA interactions for Protein: Q10567

AP1B1, AP-1 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 949 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1B1Q10567 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
AP1B1Q10567 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 240.3 ms